San Canziano liegt an der Via Gemina, der Römerstraße, die San Canzian d'Isonzo mit Triest verband. Das Dorf entwickelte sich vermutlich um das 4.-5. Jh. n. Chr.; dies zeigen zahlreiche Fundstücke aus frühchristlicher Zeit, die während der Ausgrabungsarbeiten gefunden wurden und auf die Präsenz einer größeren christlichen Ansiedlung hinweisen.